Брикс (база данных)


Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

BriX представляет собой базу данных, содержащую некоторые белковые фрагменты от 4 до 14 остатков из негомологичных белков . [1]

В Brix зарегистрировано очень мало циклов, поэтому для решения этой проблемы в систему был добавлен Loop Brix, помогающий структурировать нерегулярные элементы. Они организованы с кластеризацией концевых элементов и их расстоянием между остатками, которые фланкируют вершину пептида . В настоящее время система также поощряет загрузку структур, представленных пользователями, если они соответствуют классам Brix. [2]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Ванхи, Питер; Вершурен Эрик; Баэтен Ложь; Стричер Франсуа; Серрано Луис; Руссо Фредерик; Шимковиц Йост (январь 2011 г.). «BriX: база данных белковых строительных блоков для структурного анализа, моделирования и проектирования» . Нуклеиновые Кислоты Рез . Англия. 39 (выпуск базы данных): D435-42. doi : 10.1093/нар/gkq972 . ПМС 3013806 . PMID 20972210 .  
  2. ^ "Обзор Брикса" . Необиолаб. 28 июля 2013 г. . Проверено 3 августа 2015 г.

внешние ссылки