Амплификатор (термоциклер, ПЦР-машина) — прибор, обеспечивающий периодическое охлаждение и нагревание пробирок, обычно с точностью не менее 0,1 °C. Амплификатор используется в молекулярной биологии для амплификации ДНК методом полимеразной цепной реакции. Современные амплификаторы позволяют задавать нужное количество циклов и выбирать оптимальные временные и температурные параметры для каждой процедуры цикла.
ДНК-амплификатор (термоциклер) является программируемым термостатом с возможностью циклического повторения программы. Важнейшими характеристиками амплификатора является скорость линейного изменения и точность поддержания температуры, чем они выше, тем выше скорость и качество ПЦР. Лучшие современные модели обеспечивают скорость нагрева/охлаждения и точность термостатирования до 8 °C/сек и 0,1 °C, соответственно.
Термоблок служит для фиксации реакционных сосудов и обеспечения передачи тепла. В качестве реакционных сосудов как правило используются пробирки в том или ином исполнении. В практике наиболее часто используются одноразовые пластиковые пробирки объёмом 0,2 мл в виде отдельных пробирок, стрипов по 8 пробирок и 96-луночных планшетов. Применяется два типа термоблоков — твердотельный и роторный. Твердотельный представляет собой блок из сплава с высокой теплопроводностью с углублениями под реакционные сосуды, роторный только фиксирует пробирки, термостатирование воздушное. Оба типа имеют свои достоинства и недостатки и занимают свою нишу рынка, но приборы с твердотельным термоблоком распространены шире. Основные требования к термоблоку — высокая теплопроводность и однородность температуры, достигающая в лучших моделях 0,1 °C.
В современных моделях крышка термоблока оснащается нагревателем («горячая крышка», Hotlid) для предотвращения испарения реакционной смеси. Крышка имеет механический прижим для обеспечения плотного контакта реакционных сосудов с термоблоком и «горячей крышкой», часто регулируемый для использования с расходными материалами различной высоты. Управление регулируемым прижимом ручное или автоматизированное электромеханическое. Существует два основных варианта исполнения крышки термоблока — откидная и выдвижной термоблок (напоминает лоток CD-привода) с крышкой, размещённой внутри прибора. В устаревших моделях амплификаторов без «горячей крышки» для предотвращения испарения реакционной смеси требуется нанесение минерального масла поверх реакционной смеси.