Архейные ацидофильные наноорганизмы Ричмондских рудников


Архе́йные ацидофи́льные нанооргани́змы Ри́чмондских руднико́в (англ. Archaeal Richmond Mine acidophilic nanoorganisms, ARMAN) — организмы из домена архей, впервые описанные Бреттом Бейкером в 2006 году в экстремально кислом руднике Iron Mountain Mine[en] в северной Калифорнии. Эти новые группы архей получили названия ARMAN-1, ARMAN-2, ARMAN-3, ARMAN-4 и ARMAN-5. Аббревиатура для обозначения данной группы архей была выбрана таким образом, чтобы соответствовать фамилии владельца рудника — Ted Arman[1]. Предшествующий анализ рудниковых вод с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) не смог выявить их наличие, поскольку у организмов ARMAN имеется несколько замен, не позволяющих детектировать их с помощью ПЦР со стандартными праймерами к 16S рРНК. Бейкеру и коллегам удалось обнаружить эти организмы с помощью секвенирования ДНК организмов рудникового сообщества с помощью метода дробовика[2].

Первоначально считалось, что три группы ARMAN относятся к типу эвриархеот. Дальнейший пересмотр данных, основанный на более детально проработанном филогенетическом дереве архей, показал, что ARMAN относятся к надтипу DPANN[3]. В настоящее время ARMAN выделяют в новые типы Micrarchaeota (Candidatus Micrarchaeum acidiphilum) и Parvarchaeota, давно отделившиеся от остальных архей. Различия между генами 16S рРНК трёх первых групп ARMAN составляют 17 %[4].

Анализ с помощью флуоресцентных зондов, специфичных по отношению к ARMAN, показал, что клетки ARMAN всегда присутствуют в сообществах, связанных с кислыми дренажными рудниковыми водами[en] в руднике в Iron Mountain (северная Калифорния); pH этих рудниковых вод достигает отрицательных значений (наименьшая измеренная величина pH составила —3,6[5]). Как правило, клетки ARMAN немногочисленны в рудниковых сообществах (на них приходится 5—25 % обитателей сообществ). В 2008 году организмы, очень близкие к ARMAN, были найдены в кислом болоте в Финляндии[6], в 2010 году — в кислых дренажных рудниковых водах близ Рио-Тинто (юго-восток Испании)[7], а в 2011 году — в слабощелочном глубоком подземном горячем источнике в Японии[8].