Была учреждено 11 мая 1866 года. Названо по уездному городу Балахна Нижегородской губернии. Местопребыванием Балахнинского архиерея являлся нижегородский Печерский Вознесенский мужской монастырь. Пресеклось в 1925 году. Восстановлено 18 июля 1991 года. В 2001—2013 годы не замещалось.