Основан в 1854 году как хутор Гокинаевский. По данным Всесоюзной переписи населения 1926 года населённый пункт состоял из 31 двора; общее число жителей составляло 172 человека (89 мужчин и 83 женщины); преобладающая национальность — осетины. В 1927 году в административном отношении входил в состав Черноярского сельсовета Прохладненского района Терского округа[1]:50—51.
Населённый пункт образован в 1929 году при обустройстве зернового хозяйства, поднимать которое были посланы рабочие из Ленинграда, с Балтийского судостроительного завода — «балтийцы». Основанное, благодаря их помощи в 1930 году, советское хозяйство (совхоз) получило название «Балтийский рабочий»[8][9].
В соответствии с Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 21 сентября 1964 года посёлок Центральная усадьба совхоза «Балтрабочий» переименован в посёлок Балтийский[3].
До 16 марта 2020 года посёлок был административным центром упразднённого Балтийского сельсовета[10][11].