Больша́я Кирги́зка (сиб-тат. Кыргыз айыр[2]) — река в Томском районе, Томске и Северске, правый приток Томи. Впадает в Томь между Томском и Северском, ниже Северного (Нового) моста через Томь. Выше впадения реки Омутной называется просто Киргизка[3].
Самое древнее, из известных современной науке, поселение людей на Большой Киргизке датируется бронзовым веком (поселение Чекист ирменской культуры)[5][6].
Вскоре после основания Томска, в 1605 году (по другим данным в 1620—1621 годах[7][8] или в начале 1630-х годов[9]), в устье Большой Киргизки был основан Усть-Киргизский Алексеевский мужской монастырь, который постоянно подвергался набегам кочевников, и, в конце концов, в 1658 году был перенесён в Томск, на Юрточную гору[10], однако прежняя территория монастыря, а позднее её часть (Архимандритская заимка), находилась в распоряжении православной церкви вплоть до 1920-х годов[9]. В состав этой заимки общей площадью 5922,7 квадратных саженей (2,5 десятины) входило два участка. Первый площадью в 3024 квадратных сажени был огорожен и использовался для епархиального воскобельного и свечного завода, на этой же земле с 1877 года стояла Покровская церковь. Второй участок в 2898 квадратных саженей служил в качестве сенокосного угодья. Также здесь было 8 дачных корпусов для сдачи мест горожанам за деньги. В отличие от других дачных пригородов Томска — Басандайки и Дачного Городка — дачи на Архимандритской заимке не были общедоступными — здесь десятилетиями отдыхали одни и те же люди, которые превратили заимку в собственный закрытый посёлок[11].
В 1933 году на этих землях расположилась трудовая колония-поселение для подростков Чекист, а позже — город Северск[9].
По данным государственного водного реестра России относится к Верхнеобскому бассейновому округу, водохозяйственный участок реки — Томь от города Кемерово и до устья, речной подбассейн реки — Томь. Речной бассейн реки — (Верхняя) Обь до впадения Иртыша[4].