Команда была основана в 1961 году в составе мультиспортивного клуба «Вардар», созданного в 1947 году. В чемпионате СФРЮ команда не играла важной роли, выступая во второй лиге. Но в связи с распадом Югославии и созданием чемпионата Республики Македонии команда оказалась в числе лидеров. Команда стала постоянным участником еврокубков, а также базой для сборной Республики Македонии. Команда трижды (1998-99, 2004-05, 2010-11) выходила в полуфинал Кубка обладателей Кубков и трижды (2013-14, 2014-15, 2015-16) — в четвертьфинал Лиги чемпионов.
Сезон 2022/23