Верхнебаканский сельский округ, как сельские округа в целом, в ОКАТО и также Уставе Новороссийска[3] числится в подчинении администрации города Новороссийска. В Росстате учитывается в подчинении Приморского района.
Согласно информации с официального сайта, округ находится в подчинении Новороссийского района города Новороссийска[4][5].
Согласно ОКАТО, Уставу[3], а также информации с сайта города, учитывающей Глебовский сельский округ[5]: