Ви́ленская археологи́ческая коми́ссия — научное и просветительское общество, действовавшее в Вильне в 1855—1865.
Возникла благодаря либерализации в начале царствования Александра II Николаевича по инициативе группы виленских интеллектуалов во главе с графом Евстахием Тышкевичем. Он выступал в 1830—1840-х годах с идеей создания учёного общества и музея в Литве, где с ликвидацией виленской Медико-хирургической академии и переводом Духовной академии в Санкт-Петербург (1842) не осталось ни одного научного учреждения. С другой стороны, власти были заинтересованы в том, чтобы поставить под свой контроль деятельность патриотически настроенных энтузиастов изучения величественного и героического прошлого края.
Идея воплотилась в 1855 году с созданием Музея древностей и Временной археологической комиссии. «Положение о Музеуме древностей и Временной археологической комиссии» утверждено императором 29 апреля (11 мая) 1855. Первое заседание комиссии состоялось 11 (23) января 1856 (в дальнейшем проходили, как правило, 11-го числа каждого месяца). Музей древностей открылся в стенах Виленского университета 17 (29) апреля 1856 года, в день рождения императора Александра II. В торжестве приняло участие около трёхсот человек — православный митрополит Литовский и Виленский Иосиф (Семашко), католический епископ Вацлав Жилинский, военные и гражданские чиновники с генерал-губернатором В. И. Назимовым во главе, учителя, артисты, купцы.
Целями музея и комиссии провозглашалось собирание «в одно целое древних книг, актов, рукописей, монет, медалей, оружия, надписей и снимков с оных, статуй и прочих предметов, относящихся к истории Западного края России», содействие «сохранению памятников древности», обеспечение возможности «воспользоваться ими к изучению края, не только в историческом, но и в торговом, промышленном, сельскохозяйственном и статистическом отношении». Широким задачам соответствовали разнообразие собраний музея, широкий диапазон деятельности комиссии и её состав.