Исток реки находится в департаменте Майен. Высота истока — 153 м над уровнем моря.[источник не указан 2599 дней] Вилен впадает в Атлантический океан близ городка Треигир (Tréhiguier) в департаменте Морбиан. Река Вилен — одна из наибольших, впадающих прямо в океан, её бассейн — 9600 км²[источник не указан 2542 дня]; в своём верховье она входит в соединительную водную систему между Сен-Мало и Ренном; её главный приток (правый) — река Ульт (150 км). Полуостров Геранд разделяет устья Вилен и Луары.
Река протекает через 4 департамента: Майенн, Иль и Вилен, Луара Атлантическая и Морбиан и 4 основных города: Ренн, Витре, Редон и Ла-Рош-Бернар.
Вилен является частью системы Бритонских каналов. От Ренна до Атлантического океана река судоходна для небольших судов.