Муниципалитет или местное самоуправление (эст. kohalik omavalitsus) — наименьшая установленная конституцией административная единица Эстонии. Вся территория страны поделена между самоуправлениями.
Согласно закону, наличие местного самоуправления подразумевает право и обязанность демократическим образом сформированных местных органов власти самостоятельно осуществлять в рамках закона руководство местной жизнью, исходя из обоснованных интересов и ожиданий местных жителей и с учётом особенностей развития конкретного самоуправления.
В каждом самоуправлении имеется представительный орган власти, называемый собранием (эст. volikogu), который избирается постоянными жителями самоуправления на четырёхлетний период в ходе свободных, прямых, всеобщих и единообразных выборов при тайном голосовании. Характерной особенностью местных выборов в Эстонии, по сравнению с парламентскими, является то, что право голоса на них зависит не от наличия гражданства Эстонии, а от факта постоянного проживания на территории муниципалитета. Участвовать в голосовании имеют право все постоянные жители данного местного самоуправления, достигшие 16 лет (включая лиц без гражданства и граждан других государств). Выставлять свои кандидатуры могут, однако, только граждане Эстонии или граждане любой другой страны, входящей в Европейский Союз. Избранными не могут быть кадровые военнослужащие, а также лица, осуждённые судом за совершение преступления и находящиеся в местах лишения свободы (последние не могут также и принимать участие в голосовании).
Количество членов местного собрания колеблется в зависимости от количества жителей. Городское собрание Таллинна насчитывает 79 членов (максимум). Минимальным количеством членов собрания является 7 человек. Руководство работой местного собрания осуществляет избираемый его членами председатель (эст. volikogu esimees), который ведёт заседания, осуществляет представительские функции и подписывает принимаемые советом нормативные акты.
Наряду с собранием, в каждом местном самоуправлении имеется также и исполнительный орган власти — управа (эст. valitsus). Во главе управы стоит либо мэр (эст. linnapea) — в городах, либо волостной старейшина (эст. vallavanem) — в волостях, которые назначаются собранием на срок до четырёх лет (досрочное смещение с должности возможно по решению собрания). Глава управы представляет собранию муниципалитета на утверждение кандидатов на должности членов управы, организует работу управы, подготавливает и ведёт её заседания, издаёт приказы для организации работы управы и подведомственных ей органов и учреждений, подписывает распоряжения и постановления управы, а также выполняет представительские функции. Мэры и волостные старейшины не могут одновременно занимать какую-либо иную государственную или муниципальную должность или входить в совет коммерческой компании с муниципальным участием.