9-й чемпионат Белоруссии по футболу среди команд Второй лиги прошёл с 25 апреля по 17 октября 1999 года. Команды были разделены на две географические зоны. Победители зональных турниров — минский «Трактор» и «Лунинец» получили путёвки в Первую лигу.