ГТФ является субстратом для синтеза РНК в процессе транскрипции. Структура ГТФ похожа на гуаниловый нуклеозид, но отличается наличием трёх фосфатных групп, присоединённых к 5'-атому углерода.[1]
ГТФ играет роль источника энергии для активации субстратов в метаболических реакциях, при этом ГТФ более специфичен, чем АТФ. Используется как источник энергии в биосинтезе белка.
ГТФ принимает участие в реакциях передачи сигнала, в частности связывается с G-белками, и превращается в ГДФ при участии ГТФаз.[2]
Транслокация белков в митохондриальный матрикс включает взаимодействия как ГТФ, так и АТФ. Транспорт этих белков играет важную роль в нескольких путях, регулируемых в митохондриях, таких как преобразование оксалоацетата в фосфоенолпируват в глюконеогенезе.
Циклический гуанозинтрифосфат (цГТФ) помогает циклическому аденозинмонофосфату (цАМФ) активировать циклические нуклеотидно-управляемые ионные каналы в обонятельной системе.