Происходит от гаплогруппы JT, от которой также происходит гаплогруппа T. В популярной книге «Семь дочерей Евы» Брайан Сайкс назвал прародительницу данной гаплогруппы Жасмин (Jasmine). В медицинской генетике некоторые полиморфизмы, связанные с данной гаплогруппой, ассоциируются с наследственной оптической нейропатией Лебера.[1]
Около 45 тыс. лет назад произошла мутация в ДНК женщины, жившей на Ближнем Востоке или Кавказе. Дальнейшие мутации происходили в линиях J1a1 (27 тыс. лет назад), J2a (19 тыс. лет назад), J2b2 (16 тыс. лет назад), J2b3 (5800 лет назад), и др. Гаплогруппу J (наряду с предковой гаплогруппой JT и сестринской гаплогруппой T) связывают с распространением сельского хозяйства и пастушества в Европе в эпоху неолита (10 — 8 тыс. лет назад). Большинство прочих гаплогруппы западноевразийского происхождения (H, U, K, W, I, X), по-видимому, были связаны с племенами, сохранившими приверженность охоте и собирательству, лишь V отсутствовала в Евразии вплоть до бронзового века[2].
По другим данным гаплогруппа J образовалась примерно 58 тыс. лет назад. Субгаплогруппа J1 приурочена к ~ 33 тысячам лет назад, субгаплогруппа J1c приурочена к ~ 16 тысячам лет назад, субгаплогруппа J1c3 приурочена к ~ 11 тысячам лет назад. J1c3b наиболее распространена в северо-западной части Европы[3].
J2b1 определили у греческого образца Mik15 эпохи ранней бронзы (Manika, Early Helladic, 2890—2764 лет до н. э.)[7][8].
J1c1b1a1 определили у темнокожей представительницы фатьяновской культуры BOL002 (2829−2460 лет до н. э.) из Болшневского могильника 3 у деревни Болшнево (Бежецкий район, Тверская область)[9].
J1c+16261 (J1c-a[11]) определили у греческого образца Log04 (Logkas, Middle Helladic, 2007—1915 лет до н. э.). Log04 согласуется с двусторонней моделью примеси анатолийского неолита (∼ 38%) и степи среднего/позднего бронзового века (∼ 62%)[7].