Гражда́нская война́ в Афганиста́не (1996—2001) — вооружённая борьба между сторонниками радикального исламского движения «Талибан» и отрядами моджахедов под названием «Северный альянс». Гражданская война является логическим продолжением войны, которую в течение четырёх предшествующих лет вели между собой различные подразделения и вооружённые силы моджахедов.
Осенью «Талибан» предпринял наступление на севере от Кабула, однако Масуду при поддержке узбекских отрядов Дустума удалось отбросить противника назад к столице. Когда исламисты подошли к перевалу Саланг, Масуд устроил засаду, уничтожив 150 человек. В то же время Дустум перегородил тоннель и сдерживал атаки талибов у Саланга, а Масуд тем временем организовал контрнаступление через Чарикар и Баграм. Однако Ахмад Шах Масуд был вынужден отвести свои отряды в Панджшерское ущелье. Для того, чтобы остановить дальнейшее продвижение талибов, формирования Дустума в январе 1997 года взорвали туннель через перевал Саланг, практически полностью изолировав Север Афганистана.
Весной того же года, после традиционного зимнего затишья, активные военные действия в Афганистане шли на Западе страны, в провинции Бадгис, откуда есть единственный удобный выход к географически изолированному Северу Афганистана. Бои носили позиционный характер без явного преимущества какой-либо из сторон. Войска «Талибан» предприняли новое наступление, отбили Баграм и одновременно двинулись на север из Герата. Дустум развернул свои войска на запад, готовясь остановить талибов у Мазари-Шарифа, но его планы не осуществились.
24 мая один из командиров Абдул-Рашида Дустума генерал Абдул Малик, командующий узбекскими формированиями движения НИДА в провинции Фарьяб, поднял восстание против него и перешел на сторону противника. Войска Малика открыли талибам западный фронт в провинциях Бадгис и Фарьяб, вынудив к капитуляции формирования, верные генералу Дустуму. Поддержку генералу Малику оказали отряды движения НИДА, контролирующие стратегически важный перевал Саланг. Это сделало возможным переброску через Саланг в город Мазари-Шариф крупного формирования талибов численностью до 3 тысяч бойцов во главе с командующим северным фронтом движения Талибан муллой Абдул Реззаком и министром иностранных дел в правительстве талибов Муллой Гоусом. Генерал Дустум вынужден был бежать из страны через территорию Узбекистана в Турцию, а 25 мая талибы вступили в Мазари-Шариф — столицу буферного государства Дустума. В тот же день Пакистан официально признал движение Талибан в качестве правительства Афганистана. Через некоторое время к Пакистану присоединились Саудовская Аравия и Объединенные Арабские Эмираты.