Сэр Джон Стюарт из Бонкиля (ок. 1245 — 22 июля 1298) — шотландский полководец периода Первой войны за независимость Шотландии (1296—1328).
Второй сын Александра Стюарта (1214—1283), 4-го лорда-стюарда Шотландии (1246—1283), и Джин Макрори.
В июле 1298 года в битве с англичанами при Фолкерке сэр Джон Стюарт командовал отрядами шотландских лучников. Погиб в этом сражении.
После смерти мужа леди Маргарита в 1304 году вторично вышла замуж за сэра Дэвида из Брихина (ум. 1320)
Джон Стюарт из Бонкиля был прямым предком Генри Стюарта, лорда Дарнли, второго мужа королевы Шотландии Марии Стюарта, и короля Шотландии Якова VI Стюарта (в Англии — Яков I).