Замойская академия (польск. Akademia Zamojska; лат. Hippaeum Zamoscianum) — учебное учреждение в Замостье, основанное Яном Замойским в 1594 году. В этом же году папа Климент VIII утвердил создание академии своей буллой. В 1669 году академия получила статус университета.
Академия была основана польским гетманом и канцлером Яном Замойским в 1594 году в принадлежавшем ему городе Замосць. С 1597 кафедру моральной философии возглавлял Адам Бурский, ставший еë ректором.
С академией была тесно связана деятельность типографии. Академия была открыта 15 марта 1595 года, и после Краковской и Вильнюсской академий, стала третьим в Польше высшим учебным заведением.
В организации академии принимал участие известный поэт Шимон Шимонович. С Замойской академией также связана деятельность поэта Себастьяна Кленовича. Он находился в хороших отношениях с Яном Замойским и поощрял его к организации академии, совместно с Шимоновичем подбирал туда профессоров и сам преподавал в этом учебном заведении античную литературу.
Академия сначала состояла из трёх факультетов — свободных наук, права и медицины. Уже позже, в 1648 году, был создан еще один факультет — теологический. Выпускники академии, на основании буллы Папы Климента VII, могли получать в её стенах степень доктора по богословию, праву и медицине. Академия находилась в большой зависимости от Краковской академии и постоянно нуждалась в денежных средствах, так как назначенного Замойским содержания в 13 тысяч польских злотых на все нужды академии не хватало.
Период расцвета Академии продолжался недолго. Уже в середине XVII века она начала приходить в упадок, а в 1784 году была закрыта австрийскими властями — в результате первого раздела Польши, город Замосць перешел к Австрии. В её стенах австрийцы создали Королевский лицей, переименованный позднее в губернскую школу имени Замойских.