Основана в 1806 г. В 1928 г. состояла из 144 хозяйств, основное население — русские. Центр Исаковского сельсовета Иконниковского района Омского округа Сибирского края[2].
Могильник Исаковка 1 был найден на правом берегу Иртыша[4]. Могильник Исаковка I оставлен населением саргатской культуры (I век до н. э. — I век н. э.). Исаковский отряд СИАЭ ОмГУ под руководством Л. И. Погодина в 1989 году проводил археологические работы на курганном могильнике Исаковка I, обследовав курганы № 3—10. Курган № 3 включал семь могил; курган № 4 — две; курган № 5 — семь; курган № 6 — одиннадцать; курган № 7 — две; курган № 8 — четыре; курган № 9 — две; курган № 10 — восемь. Некоторые погребения выделялись по обилию и разнообразию погребального инвентаря, в том числе могила № 3 (более 700 золотых изделий) и могила № 6 кургана № 3; могила № 1 кургана № 4; могила № 2 кургана № 5. В погребении 6 кургана 3 (III—II века до н. э.) обнаружена могила мужчины-воина 55 лет с уникальным набором инвентаря[5]. В сосуде древнего захоронения была растительная смесь на основе ладана из смолы Босвеллии[6][7]. В керамическим кувшине, располагавшемся справа у ног в углу погребальной камеры, находилось либо пиво, либо настой трав/злаков на медовой основе. Этот кувшин — самый восточный образец северокавказского керамического импорта. Прежде в археологии саргатской культуры Кавказ звучал только в контексте распространения металлургии железа. До этого самой восточной точкой распространения северокавказского керамического импорта являлось плато Устюрт, где в святилище Терен (Мангистауский район) в погребении 2 главного культового комплекса нашли сероглиняный грубогончарный одноручный кувшин. Обе находки сходны не только по морфологическим и орнаментальным чертам, но и по наличию явных следов ремонта. По составу предметов погребальный комплекс западного Устюрта отнесён к сарматским древностям II—I веков до нашей эры[8].
Раннехорезмийские надписи, начертанные буквами арамейского письма, на двух серебряных фиалах, найденных в 1989 году в погребении 6 (курган 3) в Исаковском могильнике № 1, на керамических сосудах и остраки из хорезмских городищ Кой-крылган-кала, Калалы-гыр 2, Гяур 3, Бурлы-кала, Хумбуз-тепе можно датировать периодом от III века до н. э. до I—II веков нашей эры. О том, что надписи на исаковских чашах не арамейские по языку, а хорезмийские, можно судить по нескольким аппелятивам[9][10]. Исаковская надпись № 3 выполнена в той же технике, что и надпись № 2 из раннесарматского кургана 1 в Прохоровке Оренбургской области[11].