Кыргызская государственная медицинская академия им. И. К. Ахунбаева — ведущее высшее медицинское учебное заведение Кыргызской Республики.
В соответствии с Постановлением Совета Народных Комиссаров Кыргызской ССР от 16 апреля 1939 года было принято решение «об открытии с 1 сентября 1939 года в городе Фрунзе Кыргызский Государственный медицинский институт, с набором на 1 курс 200 человек студентов»[2]. Фундамент высшей медицинской школы закладывали профессора и преподаватели из Москвы, Санкт-Петербурга, Харькова и Киева. В 1943 году состоялся первый выпуск студентов медицинского института — 120 врачей.
В организации института неоценимое содействие оказали 1-й Московский, Ленинградский, Алма-атинский, Ташкентский и другие медицинские институты. Они оказывали консультативное и организационное содействие, обеспечивали медицинской литературой и направляли педагогические кадры для постоянной работы в институте.
В 1943 году состоялся первый выпуск студентов института в количестве 120 человек, и всего в этот год было выпущено 250 врачей. После окончания войны с 1948 года начался переход на 6-летний срок обучения.
В 70-х годах в решении проблем физиологии, патологии, адаптации организма к горным условиям медицинский институт становится ведущим в СССР.
В 1996 году указом Президента Кыргызской Республики институт реорганизован в Кыргызскую государственную медицинскую академию. 25 сентября 2008 года Указом Президента Кыргызской Республики Кыргызской государственной медицинской академии присвоено имя И. К. Ахунбаева.