Койса́нские языки́ (от нама khoi «человек» и san «бушмен») — условное название автохтонных не-банту языков юга Африки и двух изолированных языков Танзании (сандаве и хадза). Наиболее характерной их чертой является использование щёлкающих согласных (кликсов) в качестве полноценных фонем, что не встречается более нигде в мире, кроме нескольких соседних языков банту, кушитского языка дахало и исчезнувшего ритуального австралийского языка дамин.
Многие койсанские языки в настоящее время находятся под угрозой исчезновения, и немало уже вымерло. Общее число говорящих — около 370 тыс. человек. Область их распространения концентрируется вокруг пустыни Калахари.
В российской лингвистике существует специальная система обозначений для передачи щёлкающих согласных (кликсов) — в частности, в русскоязычных названиях койсанских языков.
Довольно долго койсанские языки, в соответствии с народами, говорящими на них, делились на бушменские и готтентотские. Резкой разницы в образе жизни этих народов, подкрепляемой некоторыми типологическими характеристиками (наличие именной категории рода у готтентотов), было достаточно, чтобы не замечать между этими языками ничего общего. Более того, готтентотские языки пытались объединить с другими «гендерными» языками Африки (в рамках хамитской гипотезы).
Сам термин «койсан» (нама khoi «человек» и san «бушмен») был предложен в 1928 году этнографом Л. Шульце для обозначения общего физическо-расового типа этих народов. Лишь в 1963 году Гринберг связал с этим термином предложенную им ранее макросемью (которую он сам сначала называл «Click languages» («Щёлкающие языки»)). В качестве обоснования этой гипотезы Гринберг указал на некоторые типологические сходства этих языках и их лексические параллели, а главное — на наличие в этих языках щёлкающих согласных (кликсов).
Учёные подтвердили древнюю изоляцию народов койсан от остального человечества и обнаружили среди них группы, живущие порознь в течение 30 тысяч лет. Результаты исследований опубликованы в двух работах, вышедших в журналах «Science» и «Nature Communications»[1].