Первые коммунистические группы в Сальвадоре появились в 1920-е годы. В 1929 году «Коммунистическая группа Сальвадора» приняла участие в конференции коммунистических партий Латинской Америки, прошедшей в Буэнос-Айресе в 1929 г., в работе состоявшегося в Монтевидео латиноамериканского профсоюзного съезда[4].
Партия была создана 30 марта 1930 года активистами рабочего и профсоюзного движения, среди которых были Мигель Мармоль, Модесто Рамирес и Фарабундо Марти. Первым Генеральным секретарём ЦК стал Луис Диас (плотник по специальности), секретарём по организационным вопросам — Виктор Мануэль Ангуло (учитель), секретарём по пропаганде — Хуан Кампос Боланьос (учитель). После организационного оформления, в качестве низовых партийных организаций и представительств по территориальному принципу были созданы местные комитеты, в состав которых входили 8-20 человек[5].
В условиях начавшегося экономического кризиса и ухудшения условий жизни широких масс населения страны 1930—1932 годы влияние партии расширялось, её представители вошли в руководство Региональной федерации трудящихся Сальвадора. На президентских выборах 1931 года победу одержал поддержанный коммунистами Артуро Араухо, однако в декабре 1931 года после военного переворота к власти пришел генерал Максимилиано Эрнандес Мартинес.
Партия приняла активное участие в восстании 1932 года и понесла тяжёлые потери[1], существовавшая ранее организационная структура была разгромлена, а уцелевшие активисты перешли на нелегальное положение или были вынуждены эмигрировать в другие страны Центральной Америки. В 1933 году был образован новый состав Центрального комитета, но с целью уменьшить потери от репрессий, численность партийных ячеек была ограничена до 3-4 активистов.
По состоянию на 1938 год, в составе коммунистической партии (при наличии единого руководства в лице Центрального комитета) выделились три «течения», которые возглавляли Мигель Мармоль, Тоньо Диас и Ампарита Куасаделупа.
В 1944 году партия приняла решение участвовать в восстании против Э. Мартинеса в качестве частных лиц, а не членов партии и использовать предоставленные ситуацией возможности для привлечения новых сторонников, ведения агитации и разъяснительной работы с населением.