Красная книга Республики Карелия — аннотированный список редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов Республики Карелия.
В первую (неофициальную) Красную книгу Карелии, вышедшую в 1985 году, были включены сведения о 160 видах сосудистых растений, 22 — грибов, 36 — позвоночных (9 — млекопитающих, 21 — птиц, 2 — земноводных, 4 — пресмыкающихся) и 31 — насекомых[1].
В 1995 году вышло первое издание Красной книги, подготовленное Министерством экологии и природных ресурсов Республики Карелия совместно с Карельским научным центром РАН и Петрозаводским государственным университетом[2]. Первое издание включало 755 таксонов: 390 видов и подвидов растений (в том числе 205 — сосудистых растений, 86 — мхов, 76 — лишайников и 24 вида грибов), а также 365 видов животных (из них млекопитающих — 26, птиц — 47, пресмыкающихся — 3, земноводных — 2, насекомых — 255, моллюсков и высших ракообразных — 4).
В 2007 году вышло второе издание Красной книги тиражом 2500 экземпляров в новой, изменённой и дополненной редакции. Перечень объектов растительного и животного мира, занесённых в это издание, был утверждён приказом Министерства сельского, рыбного хозяйства и экологии Республики Карелия, чего не было сделано в издании 1995 года. Теперь Красная книга Республики Карелия обрела официальный статус. В неё включены новые группы организмов, отсутствовавшие в первом издании, — это печёночные мхи и древесиноразрушающие (афиллофоровые) грибы[2]. Второе издание включало 881 таксон: 199 — сосудистых растений, 142 — мохообразных, 109 — лишайников, 61 — грибов, 23 — млекопитающих, 51 — рыб, 2 — пресмыкающихся, 1 — земноводных, 17 — рыб, 172 — насекомых, 2 — моллюсков и 2 — ракообразных[3].
В конце 2016 года перечень видов был обновлён: у части изменена категория статуса, исключены 76 объектов растительного и 35 объектов животного мира[4].
В 2020 году вышло третье, исправленное и дополненное издание Красной книги тиражом 1000 экземпляров. В отличие от предыдущего издания, в него включён Список объектов животного и растительного мира, нуждающихся в особом внимании (мониторинге)[5]. С 2020 года в перечнях редких и находящихся под угрозой исчезновения объектов растительного и животного мира на территории Республики Карелия внесено 774 объекта растительного и животного мира (к нуждающимся в особом внимании отнесены 143 таксона)[6], но третье издание включает описания только 310 таксонов (около 40 %) — это единственная Красная книга субъекта России, в которой описаны не все охраняемые таксоны.