Красная книга Томской области — официальный перечень объектов животного и растительного мира, обитающих и произрастающих естественным образом на территории Томской области и нуждающихся в специальных мерах охраны, с целью сохранения или возобновления численности их популяций.
Кроме списка видов флоры и фауны Красная книга содержат сведения о состоянии популяций, о потребности в обеспечение их охраны от факторов, вызывающих сокращение численности. Дополнительно приводятся морфологические описания и сведения о распространении, экологии и биологии исчезающих видов животных, растений и грибов. Наиболее полное издание выпускалось в 2002 году[1], которое содержало богатый иллюстративный материал и развёрнутые описания видов.
С периодичностью примерно в 10 лет происходит основательный пересмотр перечня охраняемых видов. Последнее крупное изменение в Красную книгу Томской области было внесено распоряжением Администрации Томской области от 21.11.2011 года № 1175-ра[2], которым утверждён обновленный «Перечень (список) редких и находящихся под угрозой исчезновения животных, растений и грибов.» на территории Томской области[3]. Дополнительно по мере необходимости выпускаются списки объектов животного и растительного мира, вновь внесённых в Красную книгу Томской области, либо исключенных из неё, которые дополняют, изменяют Красную книгу Томской области и являются её неотъемлемой частью[4][5].
Впервые рассмотрение редких и исчезающих видов растений и животных Томской области было предпринято учёными ТГУ в книге «Редкие и исчезающие виды животных и растений Томской области» под редакцией профессора И. П. Лаптева в 1984 году[6].
В последующие годы мониторинг редких и исчезающих видов Томской области проводился отдельными исследователями в инициативном порядке, плановый характер эта деятельность приняла после создания Государственного комитета по охране окружающей среды Томской области.
В конце 1990-х годов Администрацией Томской области был принят ряд нормативных документов, необходимых для создания «Красной книги Томской области». В 1999 году постановлением Губернатора Томской области была создана «Комиссия по редким и находящимся под угрозой исчезновения видам животных, растений и грибов на территории Томской области», в которую вошли биологи Томского университета и смежных биологического и биофизического научно исследовательских институтов. В ходе подготовки Красной книги использовались материалы из фондов и коллекций Гербария им. П. Н. Крылова и Сибирского ботанического сада, зоологического музея Томского государственного университета, сведения из литературных источников. Осуществлялось дополнительное наблюдение за популяциями некоторых видов.