Лига Алеф в Израиле была создана в сезоне 1949-50 годов, год спустя после обретения страной независимости. Однако финансовый кризис и военные действия привели к пропуску сезона 1950-1951. В сезоне 1951-1951 лига возобновила функционирование и получила название Лига Алеф. Также был пропущен сезон 1952-1953, и только в сезоне 1953-1954 соревнования возобновились. В сезоне 1955-1956 Национальная лига получила статус высшего дивизиона, и поэтому Лига Алеф стала вторым по силе дивизионом. Летом 1976 после реструктуризации Лига Арцит стала вторым дивизионом, а Лига Алеф стала третьим. В 1999 высшим дивизионом стала Премьер-лига, первым — Национальная лига, а Лига Алеф осталась третьим по силе дивизионом.
На сегодняшний день Лига Алеф разбита на 2 региональных поддивизиона, Южный и Северный. В каждом дивизионе по 16 клубов, и победители дивизионов получают путёвку в Национальную лигу. Занявшие вторые места команды играют между собой плей-офф, и победитель получает право сразиться за дополнительную путёвку в Национальную лигу с занявшей там 14-е место командой. Занявшие последние места команды переводятся в четвертый по силе дивизион — Лигу Бет.