Линн Маргу́лис[a] (англ. Lynn Margulis; 5 марта 1938, Чикаго, США — 22 ноября 2011[7]) — американский биолог, протистолог, создательница современной версии теории симбиогенеза. Профессор Массачусетского университета в Амхерсте.
Наиболее известна исследованиями клеточных органоидов и развитием эндосимбиотической теории происхождения органоидов клетки — теории, которую впервые выдвинул русский ботаник Андрей Сергеевич Фаминцын (1835—1918)[8]. Лично занималась популяризацией достижений своих предшественников, включая также русских учёных Константина Мережковского и Бориса Козо-Полянского, в том числе реализовала английский перевод книги последнего «Новый принцип биологии. Очерк теории симбиогенеза».
Она — один из авторов названия таксона Eukaryota Whittaker & Margulis, 1978 (Эукариоты), объединяющего все ядерные организмы, то есть те живые организмы, клетки которых содержат ядра (в том числе растения, грибы и животные)[9].
В 1957 году Линн Маргулис вышла замуж за американского астронома Карла Сагана (1934—1996), в будущем ставшего всемирно известным учёным, популяризатором науки. У них родилось двое детей — Дорион Саган (род. 1959) и Джереми Саган (род. 1960). В 1963 году Линн Маргулис и Карл Саган развелись.