Родился в Мидлсексе. Образование получил в Илингском колледже искусств[англ.], Лондон. С 1975 года проживает в Дартмуре, Девон. Женат, имеет двух детей.
Алан Ли проиллюстрировал десятки книг в жанре фэнтези, а также создал ряд обложек к книгам[1]. Среди его наиболее известных работ — иллюстрации к книгам Джона Рональда Руэла Толкина, включая «Властелина колец» издания 1992 года к столетнему юбилею Толкина, «Хоббит, или Туда и обратно», «Дети Хурина»[1][2].
Ли и Джон Хау были главными концептуальными дизайнерами кинотрилогии Питера Джексона «Властелин колец»[3]. Впоследствии оба иллюстратора работали над трилогией «Хоббит»[3][4]. Джексон объяснил[5], как он изначально добился участия в проекте Ли, ведущего замкнутый образ жизни. Он отправил в дом Алана на юге Англии курьером посылку с двумя своими предыдущими фильмами («Забытое серебро» и «Небесные создания»), приложив записку от себя и Фрэн Уолш, что заинтересовало Ли, и тот присоединился к съёмочной группе. Ли работал с Джексоном в качестве художника-постановщика, разрабатывая дизайн объектов, оружия и доспехов. По его эскизам были созданы дизайны Изенгарда, Мории и других локаций[5]. Также он дважды появлялся в фильмах Джексона в роли камео: в начале фильма «Властелин колец: Братство Кольца» в качестве одного из девяти королей людей, ставших впоследствии назгулами, и в фильме «Властелин колец: Две крепости» в качестве воина Рохана в оружейной (за спиной актёра Вигго Мортенсена в тот момент, когда Арагорн и Леголас говорят по-эльфийски)[6].
Также Ли занимался концептуальным дизайном в фильмах «Легенда», «Эрик-викинг», «Кинг-Конг» и в мини-сериале «Великий Мерлин[3].
Через два года после завершения кинотрилогии «Властелин колец» Ли опубликовал 192-страничную коллекцию своих концептуальных иллюстраций к ней под названием The Lord of the Rings Sketchbook (издательство HarperCollins, 2005 год)[7]. В 2019 была выпущена коллекция иллюстраций Ли к кинотрилогии «Хоббит» под названием The Hobbit Sketchbook (издательство HarperCollins, 2019 год)[8].
За иллюстрации к книге 1978 года «Феи» (Faeries), которые Ли сделал совместно с Брайаном Фраудом, номинировался на премию «Локус», заняв второе место в голосовании[9].