Миссисипская армия (англ. Army of Mississippi) — армия в составе Армии Конфедеративных Штатов Америки во время Гражданской войны в США, получившая своё название от штата Миссисипи. Таких армий было три. Их не стоит путать с Миссисипской армией (Army of the Mississippi) в составе армии США, которая получила название от реки Миссисипи.
Эта армия была основной армией Юга на Западном театре. Она была задействована в сражениях при Шайло и Перревилле. Иногда её называли Армией Запада, а в дни сражения при Шайло она иногда упоминалась как «Army of the Mississippi». Армия была сформирована 5 марта 1862 года, а 13 марта в неё влились части Армии Пенсаколы. 29 марта её объединили с Армией Центрального Кентукки и Армией Луизианы. 20 ноября 1862 года её переименовали в «Теннессийскую армию».
В марте 1862 года Миссисипская армия насчитывала 55 000 человек и стояла около Коринфа в Миссисипи. Из этого числа было выделено 44 700 человек для атаки армии Гранта при Шайло. В сражении при Шайло она состояла из 4-х корпусов.
В октябре 1862 года она насчитывала 16 800 человек и делилась на два крыла (под командованием Леонидаса Полка и Уильяма Харди). В таком виде она участвовала в сражении при Перревилле. 20 ноября 1862 года армия формально прекратила своё существование, будучи переименована в Теннессийскую армию.
Вторая армия иногда еще упоминается как «Армия Виксберга». Она была сформирована 7 декабря 1862 года из частей департамента Миссисипи и Восточной Луизианы и в неё была включена недолго просуществовавшая Западнотеннессийская армия. Обязанностью этой армии была оборона Виксберга. К началу Виксбергской кампании армия насчитывала примерно 36 000 человек. К концу кампании она состояла из четырех дивизий:Картера Стивенсона, Джона Форней, Мартина Смита и Джона Боуэна (13 бригад).
Когда Виксберг был захвачен федеральной армией, Миссисипская армия сдалась генералу Гранту 4 июля 1863 года.