Морское министерство — центральный орган военного управления Русским флотом Вооружённых сил Российской империи, было основано в 1802 году в ходе реформ Александра I, во время учреждения министерств в Российской империи, под наименованием Министерство морских сил.
Военный флот России являлся важнейшей составляющей мощи Российского государства, и являлся самой дорогой частью вооруженных сил, что и обусловило сформирование Министерство морских сил как новой формы управления военно-морскими силами Российской империи.
Наименование Морское министерство оно получило в 1815 году. Первоначально в составе министерства были образованы только военная по флоту канцелярия (1802 год) и департамент министра морских сил (1803 год). В 1805 году главное адмиралтейское управление было разделено на адмиралтейств-коллегию и адмиралтейский департамент, с присоединением их к министерству и возложением председательствования в адмиралтейств-коллегии на министра морских сил.
В 1804 году учрежден был генеральный кригсрехт для флота, вскоре упраздненный ввиду восстановления общего для морских и сухопутных вооруженных сил генерал-аудиториата, в котором положено было иметь двух членов от морского ведомства.
В 1812 году образованы аудиториатский департамент и главное медицинское управление морским ведомством, в лице флота генерал-штаб-доктора с помощником, генерал-штаб-лекарем.
В рамках Морского ведомства учреждается Управление начальника штаба по морской части, созданное в 1821 году.