Основана в 2006 году как совместный проект представителями российского и международного бизнеса. Партнёрами-учредителями бизнес-школы являются частные лица, а также российские и международные компании[2]. В июне 2019 года школа получила международную аккредитацию EQUIS EFMD[3].
С 23 марта 2022 года ректором МШУ Сколково является Александр Ким, ранее занимавший должность проректора по финансам и развитию бизнеса.
Школа входит в топ-50 рейтинга в издательстве Financial Times (Британия) по корпоративным и открытым программам бизнес-образования[4]. Школа также входит в рейтинг Financial Times по EMBA-программам, занимая в нём 58-е место и девятое место в мире по величине дохода выпускников[5].
Школа управления «Сколково» имеет международную аккредитацию EQUIS EFMD[6][7]. Школа также является участником ассоциации Global Network for Advanced Management (GNAM)[8][9][10] и членом международной сети Global Business School Network (GBSN)[11].
В начале 2000-х годов топ-менеджеры компаний Sun Group и McKinsey обратились к председателю совета директоров «Тройка диалог» Рубену Варданяну и главе МЭРТ Герману Грефу с идеей о создании в России бизнес-школы. Идея была принята, но проект не был реализован из-за отсутствия инвестиций[12].
В 2006 году группа бизнесменов во главе с Рубеном Варданяном предоставила на реализацию проекта $120 млн. (по 10 млн. с участника). Земельный участок площади 25 гектар был предоставлен Романом Абрамовичем[12]. В этом же году в компании McKinsey разработали первую стратегию для бизнес-школы.