Иоганн Петер Мю́ллер (нем. Johannes Peter Müller; 14 июля 1801 — 28 апреля 1858) — немецкий естествоиспытатель XIX века, биолог, анатом, физиолог.
Член Прусской академии наук (1834)[9], Германской академии естествоиспытателей «Леопольдина» (1824)[10], иностранный член-корреспондент Петербургской академии наук (1832)[11], иностранный член Лондонского королевского общества (1840)[12], член-корреспондент Парижской академии наук (1845)[13].
Иоганн Петер Мюллер родился в Кобленце, который в то время был столицей департамента Рейн и Мозель в составе Первой Французской республики. Сын сапожника, который сделал всё возможное, чтобы дать сыну образование. В Кобленце он учился в королевской гимназии. В то время там преподавал влиятельный политический публицист Йозеф Гёррес, позднее гимназия стала носить его имя. Уже во время учёбы в гимназии И. Мюллер делал свои собственные переводы Аристотеля[14]. После окончания школы один год служил добровольцем в инженерных войсках.
В 1819 году поступил в Боннский университет сначала с целью изучать католическую теологию, но уже через несколько дней перешёл к изучению медицины. Будучи студентом, он получил награду за исследование о дыхании зародыша.
В 1822 году получил степень доктора за диссертацию: «Dissertatio inauguralis, physiologica sistens commentaries de phoronomia animalium», а в следующем году издал «De respiratione foetus commentatio physiologic a in academio borussicarhenana praemio ornata» (Лейпциг, 1823).
Весной 1823 года он, получив государственную поддержку, отправился в Берлин, где посещал лекции Рудольфи. Знакомство с Рудольфи имело для него большое значение и освободило его от склонности к натурфилософии того времени.