О́тто Фредери́к Мю́ллер (дат. Otto Frederik (Friedrich, Friderich, Fridrich) Müller, 11 марта 1730 — 26 декабря 1784) — датский учёный, естествоиспытатель.
Уже первым своим трудом «Fauna Insectorum Fridrichsdalina» (1764), заключающим определение 858 видов насекомых, Мюллер обратил на себя внимание не только на родине, но и за границей.
Мюллер оставил после себя ряд капитальных учёных трудов по зоологии, включая энтомологию, и ботанике.
Zoologiae Danicae Prodromus стало первым систематическим изданием по датской и норвежской зоологии, и в течение многих лет — наиболее полным. Эта работа была запланирована как начало большого обзора фауны, но до своей смерти Мюллер успел выпустить только один том. Следующие тома (публикация которых была продолжена в 1806), готовившиеся к печати, среди прочих, Сёреном Абильдгаардом и Мартином Генрихом Ратке, не достигли уровня полноты охвата описания видов «Flora Danica», начатой по инициативе Георга Христиана Одера (нем. Georg Christian Oeder).