Наказной полковник — в XVII—XVIII веках лицо, временно выполнявшее функции казачьего полковника, на Гетманщине и на Слобожанщине.
Назначался полковником, или в случае отсутствия полковника, полковой старши́ной из состава той же полковой старшины.
В отличие от казачьего полковника, должность наказного полковника была исключительно военной. Наказной полковник имел право издавать указы за своей подписью — универсалы. Символом власти, как и у полковника, был: шестопёр (пернач, разновидность булавы шестигранной формы), полковая хоругвь, полковничья печать.
Назначали наказного полковник для руководства полком (или выделенной его частью) в походе, когда полковник оставался в полковом городе или по различным другим причинам, когда полковник не мог сделать этого лично (например, длительное его отсутствие в полку, болезнь, смерть).
Назначение наказного полковника оформлялось универсалом полковника или же грамотой за подписью членов полковой старшины и скрепленной полковой печатью.
Наказной полковник подчинялся, в первую очередь, своему полковнику, при его отсутствии царю (в виде его представителя, к примеру, белгородского воеводы). Во время похода, был в подчинении командира того подразделения куда входил его отряд (полк).