Образован 30 января 1931 года выделением речного и морского транспорта и их хозяйств из Наркомата путей сообщения СССР.
15 марта 1953 года объединено с Министерством речного флота СССР в одно — Министерство морского и речного флота СССР.
15 марта 1953 года объединено с Министерством морского флота СССР в одно — Министерство морского и речного флота СССР.
Образовано 15 марта 1953 года при объединении Министерства морского флота СССР, Министерства речного флота СССР и Главного управления Северного морского пути при СМ СССР.
25 августа 1954 года разделено на Министерство морского флота СССР и Министерство речного флота СССР.
29 мая 1939 года принят Закон СССР об образовании в союзных республиках народных комиссариатов автомобильного транспорта. Наркомат автомобильного транспорта РСФСР образован 28 июня 1939 года постановлением Президиума Верховного Совета РСФСР.