По состоянию на 2020 год число сельских населённых пунктов составило 8012. В 2020 году ряд сельских населённых пунктов был упразднён[4][5].
В списках населённые пункты распределены по административно-территориальным единицам в рамках административно-территориального устройства области: 4 городам областного значения и 26 районам[2] (в рамках организации местного самоуправления (муниципального устройства) им соответствуют 2 городских округа и 26 муниципальных районов).
Численность населения сельских населённых пунктов приведена по данным переписи населения 2010 года[6], численность населения городских населённых пунктов (посёлков городского типа (рабочих посёлков) и городов) — по данным переписи по состоянию на 1 октября 2023 года[6].
Город областного значения Великий Устюг с административно подчинёнными населёнными пунктами входит в состав Великоустюгского района и соответствующего муниципального района.
Город областного значения Сокол входит в состав Сокольского района и соответствующего муниципального района.
В 1999 году был утверждён реестр административно-территориального устройства Вологодской области, содержащий полный список населённых пунктов области[7]. Каждому населённому пункту был присвоен собственный номер. Таким образом, каждый НП Вологодской области имеет 2 уникальных идентификатора — регистрационный номер и код ОКАТО. 1 марта 2010 года был утверждён обновлённый реестр административно-территориальных единиц Вологодской области, учитывающий изменение статусов, упразднение и регистрацию новых населённых пунктов[8].