Оборона Самарканда 1868 года — защита русскими императорскими войсками крепости Самарканд во время Туркестанских походов.
После победы над бухарскими войсками под Ирджаром генерал фон Кауфман предложил эмиру Музаффару утвердить новый проект границ, изменённый в пользу России. Отказ бухарской стороны подписать его весной 1868 года привёл к возобновлению военных действий. Кауфман, обвинив эмира в подготовке к вторжению во владения империи, собрал военный отряд из более чем 4 тысяч солдат, в апреле 1868 года приступил к Зеравшанскому походу и принял решение о взятии Самарканда — крупнейшего города эмирата.
К этому времени бухарские войска расположились на самаркандских высотах Чупан-аты. 1 мая 1868 года началась атака русских войск на высоты. Невзирая на сплошной огонь ружей и пушек сарбазов, русские солдаты, перейдя реку и разгромив авангард бухарцев, взобрались на высоту Чупан-аты и вынудили тех отступить.
Серия поражений привела в мае 1868 года войска бухарского эмира Музаффара к воротам Самарканда, за крепкими стенами которого они предполагали укрыться, но жители города, разорённые бесконечными поборами, закрыли перед бухарской армией ворота.
14 (26) мая 1868 года русские войска заняли Самарканд, с конца XVIII века находившийся во власти династии Мангытов, правящей Бухарским эмиратом.
Для упрочения положения в долине Зеравшана генерал Кауфман отправил в разные места отряды для разгрома бухарских войск и для овладения некоторыми укреплёнными пунктами. Сам командующий русскими войсками выдвинулся 30 мая против эмира, оставив в Самарканде небольшой отряд. В Самарканде остались 4 роты пехоты, одна рота сапёр, 2 орудия и 2 мортиры. Гарнизоном командовал майор Штемпель, в его распоряжении находилось 660 штыков, в том числе больные.