Омикрон-вариант SARS-CoV-2 (SARS-CoV-2 Omicron, SARS-CoV-2 B.1.1.529) — вариант коронавируса SARS-CoV-2[1], впервые идентифицированный в Ботсване и ЮАР в ноябре 2021 года, отличающийся большим числом мутаций в пепломерах.
При заражении омикрон-вариантом, согласно данным Всемирной организации здравоохранения, заболевание протекает легче или так же, как при заражении дельта-вариантом. Однако быстрое распространение нового варианта может привести к высокой нагрузке на систему здравоохранения, а вызванный им общий риск ВОЗ оценивает как «очень высокий»[2]. Может заражать переболевших и вакцинированных[3].
По данным на конец декабря 2021, быстро вытеснял дельта-вариант в тех странах, где начал распространение[4]. Обнаружен более чем в 100 странах мира .
В России, по информации на 7 июня 2022 года, на омикрон приходилось 98,29 % от выявленных в стране случаев заболевания COVID-19, на дельта-вариант — 0,43 %, на прочие варианты — 1,28 %[5] .
Он характеризуется большим количеством мутаций в спайковом (шиповидном) белке, их более 30[7]: A67V, Δ69-70, T95I, G142D/Δ143-145, Δ211/L212I, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G446S, S477N, T478K, E484A, Q493K, G496S, Q498R, N501Y, Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K і L981F, а также мутацией ORF1b:T2163I, ранее известной по дельта-субварианту AY, широко распространённому в Европе[6].
Омикрон-штамм имеет много уникальных особенностей. Часть его мутаций похожа на мутации дельта- и бета-штаммов, однако, по данным на конец ноября 2021 года, ранее не были выявлены штаммы с промежуточными мутациями, которые обычно происходят при эволюции «дикого» вируса. Отсутствие промежуточных мутаций вируса в популяции необычно и оказалось неожиданным для вирусологов[8].