В 1986 году Жак Готье ввёл в систематику группу Ornithodira, содержащую общих предков динозавров, птерозавров и их ближайших родственников[2]. В 1991 году Пол Серено дополнил кладистику и включил в неё таксон Scleromochlus, расширив таким образом кладу Готье[3]. Однако в 1999 году Майкл Бентон пришёл к выводу, что Scleromochlus не родственен другим животным клады Ornithodira, и сформулировал определение для материнской клады Avemetatarsalia для архозавров, которые по ряду синапоморфных признаков ближе к динозаврам, чем к крокодилам[4]. В 2011 году Стерлинг Несбит обновил определение клады орнитодир: наименее инклюзивная клада, содержащая Pterodactylus antiquus Sommerring, 1812 и Passer domesticus Linnaeus, 1758[5]:206.
Кладограмма по филогенетическому анализу С. Несбитта и соавторов (2017)[10], с названиями клад по работе А. Кау (2018)[11]: