Отделе́ние теорети́ческой и прикладно́й лингви́стики (ОТиПЛ) создано на филологическом факультете МГУ в 1960 году; название для нового отделения было предложено В. А. Успенским. С сентября 1962 по март 1992 года называлось Отделением структурной и прикладной лингвистики (ОСиПЛ)[1]. В связи с изменением номенклатуры вузовских специальностей c 2011 года слово «теоретической» в названии отделения было заменено на «фундаментальной»[2].
В 1962—1982 годах подчинено кафедре структурной и прикладной лингвистики, в 1982—1988 годах — кафедре общего, сравнительно-исторического и прикладного языкознания (в период фактической ликвидации кафедры СиПЛ), в 1988—1992 годах — кафедре прикладного языкознания, с 1992 года — кафедре теоретической и прикладной лингвистики.
Основные направления научной и учебной деятельности: теоретическое языкознание, лингвистическая типология, описание языков (полевая лингвистика), различные области прикладной лингвистики. Преподаётся высшая математика.
Первый заведующий кафедрой — д.фил.н. В. А. Звегинцев (1962—1982), вторым заведующим был член-корр. РАН А. Е. Кибрик (1992—2012). В 2013 году в должности заведующего был утверждён выпускник и один из основных преподавателей отделения, акад. В. А. Плунгян. Весной 2017 года новым заведующим кафедрой стал также выпускник и преподаватель отделения, д.фил.н. С. Г. Татевосов.
В истории гуманитарной науки в СССР Отделение сыграло исключительно важную роль, так как было одним из немногих относительно успешных опытов создания автономного научного сообщества, более или менее свободного от давления официальной идеологии и ориентирующегося на свободный поиск научной истины и освоение достижений мировой науки.
Отделение было создано по инициативе математиков (прежде всего В. А. Успенского) и при поддержке А. Н. Колмогорова с учётом опыта действовавшего несколько лет до этого на филологическом факультете МГУ семинара «Некоторые применения математических методов в языкознании» (активными участниками семинара были В. А. Успенский, Вяч. Вс. Иванов, П. С. Кузнецов, А. А. Зализняк и др.). Именно с этого семинара начались попытки освободить советскую лингвистику от отставания и изоляции, в которую она попала после катастрофического периода насильственного господства марризма, а потом насильственного же его ниспровержения (при этом отказ от находившегося вне рамок науки учения Марра отнюдь не означал признания советскими идеологами «буржуазных» теорий языка, в том числе структурализма, господствовавшего тогда на Западе). Огромную роль в успехе этого процесса сыграли теоретическое видение, интеллектуальная честность и смелость В. А. Звегинцева, который практически единолично вернул семантику в советскую лингвистику и популяризовал структурные теории в серии переводов «Новое в лингвистике».