Парламентские выборы состоялись в Эстонии 7 марта 1999 года[1]. Выборы имели катастрофические последствия для Эстонской коалиционной партии (Eesti Koonderakond), которая, вместе с двумя своими небольшими союзниками, получила только семь мест в парламенте. Эстонская партия селян, которая участвовала в выборах вне коалиций, также получила семь мест.
Программа правительства Марта Лаара была подписана партиями Союз Отечества, Партией реформ Эстонии, Народной партией умеренных и Народной партией. Последние две вскоре после этого объединились, таким образом второе правительство Марта Лаара стало широко известно как Kolmikliit или Трехпартийная коалиция. Несмотря на различия в политических идеологиях правящих партий, коалиция оставалась единой до тех пор, пока Март Лаар не ушел в отставку в декабре 2001 года, после того, как аналогичная коалиция распалась в муниципалитете Таллинна, что сделало лидера оппозиции Эдгара Сависаара новым мэром Таллина. После отставки Лаара, Партия реформ и Центристская партия Эстонии сформировали коалицию, которая продержалась до следующих парламентских выборов в 2003 году.
Избирательный барьер был установлен на уровне 5 % голосов. Избирательные картели были запрещены, но это не помешало партиям включать членов других партий в свои избирательные списки.
b В партийный список Эстонской коалиционной партии были включены представители Эстонского союза селян и Партии эстонских пенсионеров и семей.
c В партийный список Объединенной народной партии Эстонии были включены представители Эстонской социал-демократической рабочей партии и Русской партии единства.