Патологи́ческая анато́мия — научно-прикладная дисциплина, изучающая патологические процессы и болезни с помощью научного, главным образом микроскопического, исследования изменений, возникающих в клетках и тканях организма, органах и системах органов.
Патологическая анатомия является одной из основных медицинских дисциплин и обязательна для изучения в медицинских вузах.
В патологической анатомии выделяют два направления: патологическая анатомия человека (медицинская патологическая анатомия) и патологическая анатомия животных, в частности, важное практическое значение имеет патологическая анатомия сельскохозяйственных животных. В фитопатологии не принято пользоваться термином «патологическая анатомия», говорят о морфологических изменениях растений (патологическая морфология растений). В данной статье обсуждается только медицинская патологическая анатомия, в дальнейшем обозначаемая общим термином без уточняющего определения.
Термины «патологическая анатомия» и «врач-патологоанатом» в настоящее время применяются для обозначения медицинской дисциплины в основном в Российской Федерации и ряде стран бывшего СССР и социалистического лагеря. В Европе и США используются понятия «патология» (pathology) и «патолог» (pathologist), однако полными синонимами эти понятия не являются: патология использует более широкий круг методов для диагностики заболеваний.
Поскольку основными методами патологической анатомии являются морфологические, данная дисциплина часто обозначается как патологическая морфология (патоморфология), но этот термин имеет гораздо более широкое значение: патоморфологические изменения в организме больного, его органах и тканях исследуют врачи различных клинических и параклинических специальностей, а не только патологоанатомы.
В непрофессиональной среде патологоанатомом нередко называют судебно-медицинского эксперта, что связано с использованием в патологической анатомии и судебной медицине метода вскрытия тел умерших. Тем не менее «Патологическая анатомия» и «Судебно-медицинская экспертиза» являются различными специальностями.