Второй сезон Первенства Молодёжной хоккейной лиги стартовал 15 сентября 2012 года и завершился в 11 апреля 2013 года. Обладатель Кубка Регионов стал курганский «Юниор», обыграв в финале нефтекамский «Батыр».
На первом этапе в дивизионах «Северо-Запад» и «Поволжье» клубы сыграют между собой в четыре круга (каждая команда проведёт по 40 матчей в дивизионе «Северо-Запад», по 44 матча в дивизионе «Поволжье»), в дивизионе «Урал-Сибирь» — в шесть кругов (по 42 матча). В плей-офф попадут по шесть лучших клубов из дивизионов «Северо-Запад» и «Поволжье», а также четыре лучшие команды из дивизиона «Урал-Сибирь». Серии плей-офф проводятся до трёх побед.
По итогам сезона победитель группы «Б» осуществит взаимный переход с 32-й и 33-й командой группы «А».