XXI Первенство России среди любительских футбольных клубов прошло в 2012—2013 годах. В зонах «Дальний Восток», «Приволжье», «Золотое кольцо», «Москва» и «Московская область» соревнования прошли только в 2012 году, что обусловлено возвращением этих зон на старую систему «весна-осень».
В связи с переходом зоны на старую систему «весна-осень» первенство прошло в два круга со 2 июня по 15 октября 2012 года[1].
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
Победа хозяев поля Ничья Победа гостей
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
* Команда «Сибирь-Заря-М» снялась с соревнований.
И — игры, В — выигрыши, Н — ничьи, П — проигрыши, Мячи — забитые и пропущенные голы, ± — разница голов, О — очки
* Команда «Автомобилист» снялась с соревнований после первого круга.