В 641 году был обвинен в покушении на жизнь Константина III. Пирр оставил патриарший престол и затем был сослан в Африку.
В 645 году принял участие в диспуте с монахом Максимом Исповедником по поводу монофелитства. В результате Пирр согласился с Максимом и отрекся от своих взгядов. Однако вскоре он опять объявил себя монофелитом.
В январе 654 года был вновь возведен на патриаршую кафедру Константинополя. Умер Пирр 1 июня в том же году.