Блэкторн родился в графстве Шропшир, Англия, однако большую часть детства провёл на британских военных базах в Англии и Германии[1].
Блэкторн начал актёрскую карьеру со съёмок в рекламе. Его заметили после участия в рекламе компании Virgin Atlantic Airways, где он сыграл парня, перед которым проносится вся его жизнь, когда за ним приходит Смерть.
В 1999 году Блэкторн снялся в нескольких эпизодах британского сериала «Максимум практики» и документальном фильме «Фантастический мир Брета Истона Эллиса». В 2001 году он дебютировал в кино, снявшись в роли капитана Эндрю Расселла в номинированном на премию «Оскар» индийском фильме «Лагаан: Однажды в Индии», для этой роли он шесть месяцев изучал хинди. В том же году он исполнил роль Гая Мортон в британском сериале «Холби Сити» и роль Дэна в фильме The Truth Game.
В 2002—2003 годах Блэкторн играл главную роль доктора Мэтта Слингерленда в сериале «Клиника Сан-Франциско». В 2003 году он снялся в короткометражном фильме Mindcrime, а в 2004 году появлялся в ролях второго плана в телесериалах «Скорая помощь» и «24 часа». В 2005 году Блэкторн сыграл в инди-фильме «Четыре направления пригорода», получившем награды Crossroads Film Festival и Авиньонского фестиваля.
В 2006 году он сыграл роль Джонаса Эксайлера в фильме «Особый парень: Тупой супергерой» с Майклом Рапапортом в главной роли. В 2007 году он сыграл главную роль профессионального волшебника Гарри Дрездена в сериале канала Sci Fi «Файлы Дрездена», а в 2008—2009 годах играл второстепенную роль Шейна Хили, музыканта и мужа Венди Хили, сыгранной Брук Шилдс, в сериале «Помадные джунгли» В 2010 году Блэкторн сыграл роль Кристиана Харпера в сериале «Врата». Также он появлялся в эпизодах таких сериалов, как «Медиум», «Дедвуд» и «Детектив Монк», «Чёрная метка», «Воздействие», «C.S.I.: Место преступления Майами», «Хранилище 13», «Белый воротничок» и других.
В 2012 году Блэкторн сыграл роль Кларка Куайетли в сериале канала ABC «Река», сюжет которого сфокусирован на группе людей, отправившихся на поиски исследователя природы, пропавшего в Амазонке, а в 2012—2018 годах исполнял роль детектива Квентина Лэнса, отца сестер Сары и Лорелл Лэнс, в сериале «Стрела»[2]. В 2014 году Блэкторн появился в фильме «Тупой и ещё тупее 2», а в 2017 году — в фильме «Дейзи Уинтерс». В 2019 году он играл одну из главных ролей в сериале «Проводник».