РНК-содержащие вирусы — вирусы, геном которых представлен рибонуклеиновой кислотой[1]. Обычно она одноцепочечная (оцРНК), но может быть и двуцепочечной (дцРНК)[2]. Наиболее серьёзными заболеваниями человека, вызываемыми РНК-вирусами, являются геморрагическая лихорадка Эбола, ТОРС, COVID-19, бешенство, простуда, грипп, гепатит C, гепатит E, лихорадка Западного Нила, полиомиелит и корь.
Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) относит РНК-вирусы к группам III, IV или V по системе классификации вирусов по Балтимору и не считает РНК-вирусы вирусами, имеющие промежуточную стадию жизненного цикла в виде ДНК[3]. Такие вирусы, с РНК в качестве генетического материала и имеющие промежуточную стадию жизненного цикла в виде ДНК в цикле репликации, названы ретровирусами, и выделены в группу VI классификация вирусов по Балтимору. Важные ретровирусы человека включают ВИЧ-1 и ВИЧ-2, вызывающих ВИЧ-инфекцию.
Другим термином, явно исключающий группу ретровирусов из РНК-вирусов, является термин рибовирусы[4].
РНК-вирусы могут быть дополнительно классифицированы в соответствии с полярностью их РНК на одноцепочечные РНК-вирусы с отрицательной цепью и одноцепочечные РНК-вирусы с положительной цепью, или РНК обеих типов двухцепочечные РНК-вирусы. Одноцепочечная (+)РНК, подобная мРНК и способная непосредственно транслироваться зараженной клеткой, называется смысловой. Антисмысловая (-)РНК вируса комплиментарна мРНК и таким образом может быть превращена в (+)РНК действием РНК-зависимой РНК-полимеразой перед трансляцией. Очищенная РНК (+)РНК-содержащих вирусов сама по себе может напрямую вызывать инфекцию, хотя её инфекционность ниже, чем у полноценных вирусных частиц. Очищенная РНК (-)РНК-содержащих вирусов неинфекционна сама по себе, так как она должна транскрибироваться в (+)РНК; каждый вирион после транскрипции может быть источником нескольких смысловых цепей (+)РНК. Двухцепочечные (±)РНК вирусы напоминают (-)РНК-содержащие вирусы тем, что они также транслируют гены с отрицательной (некодирующей) цепи РНК[5].
Двуцепочечные РНК-вирусы — разнообразная группа вирусов, отличающихся хозяевами (люди, животные, растения, грибы или бактерии), числом фрагментов генома (от 1 до 12 сегментов), и организацией вириона (формой капсида, количеством слоев капсида, выросты, шипы, и т. п.). Члены этой группы включают ротавирусы, всемирно известные как наиболее распространённая причина детских гастроэнтеритов, и пикорнавирусы, известный во всём мире как наиболее часто встречающийся вирус в фекалиях людей и животных с признаками диареи или без них. Вирус болезни синего языка является экономически важным возбудителем болезни коз и овец. В прошлые годы, достигнут большой прогресс в определении атомной и субнанометровой структуры ряда ключевых вирусных белков и капсидов вирионов нескольких дцРНК-вирусов, подчёркивая существенные параллели в структуре и механизмах процессов репликации многих из этих вирусов[2].