Система APG II — таксономическая система классификации цветковых растений, разработанная «Группой филогении покрытосеменных» (Angiosperm Phylogeny Group) и опубликованная в 2003 году в статье «An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG II»[1].
Система APG II является преемницей Системы классификации APG (1998). Каждая из этих систем отражала консенсус мнений широкого круга учёных-ботаников, объединённых в «Группу филогении покрытосеменных» (APG) и работающих в ряде институтов разных стран.
На смену Системе APG II в 2009 году пришла Система классификации APG III, уступившая затем место версии APG IV в 2016 году.
Ниже в табличной форме приведена схема системы APG II с указанием названий порядков и числом семейств.
Каждое перечисление начинается с семейств и порядков, для которых ещё не определено место в последующей кладе. Семейства, входящие в состав порядков, в данном списке не приводятся.
В дополнительный список семейств и родов, не имеющих в системе APG II определённого места, входят ещё три семейства: