После смерти Германа II, последнего из династии Эццоненов, Пфальц потерял свою военную важность для Лотарингии. Территория пфальцграфства сокращена до округов вокруг Рейна, с тех пор названного «Пфальцграфство Рейнское».
В 1156 году император Фридрих I Барбаросса передал эти земли в наследственное владение своему младшему брату Конраду.
В 1195 году Пфальц перешёл к династии Вельфов в результате женитьбы Генриха Вельфа на Агнессе, дочери Конрада Гогештауфена.
В начале XIII века, в результате брака Агнессы, дочери Генриха V и внучки Конрада Гогенштауфена и Отто, герцога Баварии, территория Пфальца перешла к династии Виттельсбахов герцогам Баварии. В результате представители этой династии были какое-то время одновременно и герцогами Баварии, и пфальцграфами. Различные ветви династии Виттельсбахов управляли Пфальцем до упразднения его как самостоятельного государства в 1803 году и далее до 1918 года. С этого времени лев стал геральдическим символом гербов Баварии и Пфальца.
Позднее, в результате раздела территории между наследниками Людвига II в 1294, старшая ветвь Виттельсбахов получила вошла во владение и Рейнское пфальцграфство, и территории в баварском «Nordgau» (Бавария к северу от реки Дунай) с центром в городе Амберг. Поскольку этот регион был политически связан Рейнским пфальцграфством, он получил название «Верхний Пфальц» («Oberpfalz») в отличие от «Нижнего Пфальца», расположенного на берегах Рейна.
По условиям соглашения, заключённого в Павии в 1329, император Людвиг IV, сын Людвига II, возвратил Пфальц своим племянникам Рудольфу и Руперту.