Среднедиэнцефалический организатор, или СДО (англ. mid-diencephalic organizer, MDO) — это эмбриональная структура, образующаяся на границе между будущим таламусом («дорсальным таламусом») и будущим субталамусом (или, иначе говоря, будущим преталамусом, периталамусом, «вентральным таламусом») в процессе развития эмбрионального промежуточного мозга. После своего формирования среднедиэнцефалический организатор управляет всем процессом дальнейшего созревания и зональной организации будущего таламуса и будущего субталамуса.
После завершения процесса эмбрионального созревания и зональной организации таламуса и субталамуса среднедиэнцефалический организатор прекращает своё функционирование, и превращается в так называемую ограниченную внутриталамическую зону (лат. zona limitans intratalamica, ZLI), узкой полоской отделяющую таламус от субталамуса.
В области стыка между доменами экспрессии белков факторов транскрипции Fez и Otx (то есть на границе между будущим субталамусом, и будущим таламусом), в эмбриональном таламическом комплексе формируется так называемая среднедиэнцефалическая организующая структура, или среднедиэнцефалический организатор (англ. mid-diencephalic organizer, MDO). Среднедиэнцефалический организатор является своего рода «дирижёром оркестра», главным организатором всего последующего процесса эмбрионального развития таламуса и субталамуса, рассылающим необходимые для правильной дифференцировки клеток ядер таламуса и субталамуса межклеточные сигналы. Отсутствие среднедиэнцефалического организатора приводит к отсутствию таламуса и нередко также субталамуса в развивающемся мозге эмбриона. Сам среднедиэнцефалический организатор созревает в процессе эмбрионального развития таламического комплекса в направлении от более вентральных его частей, созревающих раньше, к более дорсальным, которые созревают позже. Белки, принадлежащие к семействам SHH и Wnt, являются главными регуляторными и дифференцировочными сигналами, испускаемыми средне-диэнцефалическим организатором.
Кроме своей функции как «дирижёра оркестра», управляющего всем процессом дальнейшего эмбрионального развития таламуса и субталамуса, среднедиэнцефалический организатор впоследствии созревает в особую гистологическую структуру внутри таламуса, так называемую «ограниченную внутриталамическую зону» (лат. zona limitans intrathalamica (ZLI)).