Город расположен на левом берегу реки Купавинки (бассейн реки Клязьмы), в 15 км от Ногинска, в 22 км от Москвы (МКАД) и в 36 км от центра. К югу от города располагается реликтовое озеро Бисерово.
Слово Купавна соответствовало живописной, красивой местности. Вблизи села протекало несколько речек: Купавна, Чудинка, Кудинка и Шаловка. Кроме рек здесь были озёра с зеркальной водой. Одно из них находилось на месте сегодняшних Озерков, другое на территории комбината «Акрихин». Последнее просуществовало до сороковых годов двадцатого столетия.
Но откуда же такое благозвучное название? На Руси часто бывало так, что селение, расположенное рядом с речкой, принимало её название. А вот откуда взялось название Купавна у речки?
Исследователи пишут, что так называли на Руси красавиц — «пригожая красивая женщина». У А. С. Пушкина: «А сама-то величава, выступает словно пава…» Пава — Купава — Купавна — красавица. У Даля в толковом словаре: Купавая — пышная, гордая красава… Пава.
Однако, считается, что слово «купавна» связано с названием цветка. Даль в своём толковом словаре пишет, что купава — водяное растение, кувшинка.
Купавна, купавка — цветущее растение, которое встречается в русских народных ботанических названиях. Во Владимирской губернии купавкой называют цветок с пушистым венчиком. В Тверской, Новгородской и других областях так называют водяные или болотные растения, растущие по сырым и болотистым местам. Село как раз и стояло среди торфяников Бисерова и Кудинова.