Степан Томаш был незаконным сыном короля Стефана Остоя. Он взошёл на трон после смерти в 1443 году бездетного короля Твртко II.
В молодости Степан Томаш, как и большинство жителей Боснии, был богумилом, однако впоследствии принял католичество. 19 мая 1445 года папа Евгений IV признал его королём Боснии и дал разрешение на развод с Воячей. 26 мая 1446 года Стефан Томаш женился на Катарине, дочери богатого герцога Степана Вукчича Косача из современной Герцеговины, что положило конец политической нестабильности в стране.